Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOT2Q8IXI1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOT2Q8IXI1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms