Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPM2Q86SE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPM2Q86SE8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms