Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTOP1Q7RTM1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP1Q7RTM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms