Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFVQ71UI9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFVQ71UI9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms