Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMUB2Q71RG4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms