Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BBS12Q6ZW61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms