Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATF7IPQ6VMQ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATF7IPQ6VMQ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF7IPQ6VMQ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms