Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRIG3Q6UXM1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIG3Q6UXM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms