Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCIMPQ6UWF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms