Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L2Q6R6M4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L2Q6R6M4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms