Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM88Q6PEY1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM88Q6PEY1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms