Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRR27Q6MZM9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRR27Q6MZM9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms