Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT39Q6A163 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT39Q6A163 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms