Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SZT2Q5T011 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SZT2Q5T011 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms