Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM41BQ5BJD5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM41BQ5BJD5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms