Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
UVSSAQ2YD98 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UVSSAQ2YD98 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms