Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGISQ16647 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGISQ16647 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGISQ16647 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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