Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPE65Q16518 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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