Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDGFRLQ15198 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDGFRLQ15198 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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