Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CYP3A5-215ENST00000489231 622 ntTSL 25.1□□□□□ -1.594e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-208ENST00000466061 1564 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.64e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-213ENST00000481825 2857 ntTSL 1 (best)4.98□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-210ENST00000474664 960 ntTSL 24.39□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 EIF4A2-209ENST00000461021 575 ntTSL 24.34□□□□□ -1.714e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-210ENST00000469887 3149 ntTSL 54.34□□□□□ -1.724e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-211ENST00000493110 408 ntTSL 54.2□□□□□ -1.744e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-205ENST00000461920 2208 ntTSL 24.07□□□□□ -1.764e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-203ENST00000467362 5300 ntTSL 23.84□□□□□ -1.794e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-212ENST00000480723 584 ntTSL 33.83□□□□□ -1.84e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-207ENST00000469942 6463 ntTSL 23.6□□□□□ -1.834e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CYP3A5-204ENST00000456417 594 ntTSL 53.46□□□□□ -1.864e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CEPT1-204ENST00000473474 764 ntTSL 53.31□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.884e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-203ENST00000525325 560 ntTSL 33.17□□□□□ -1.94e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-206ENST00000527508 531 ntTSL 22.7□□□□□ -1.984e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 NCOR1-217ENST00000579606 551 ntTSL 42.53□□□□□ -24e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB14-203ENST00000420137 3442 ntTSL 1 (best)1.85□□□□□ -2.114e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SSBP4-210ENST00000601444 427 ntTSL 519.42■□□□□ 0.78e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ADAMTS10-208ENST00000596709 980 ntTSL 523.5■■□□□ 1.358e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ADAMTS10-202ENST00000593534 630 ntTSL 320.2■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GGT1-226ENST00000487766 638 ntTSL 219.93■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ADAMTS10-209ENST00000596851 3423 ntTSL 214.78□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ADAMTS10-207ENST00000596466 836 ntTSL 513.12□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 212.01□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 YIPF3-211ENST00000503147 652 ntTSL 211.99□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 FLOT2-203ENST00000465427 746 ntTSL 511.39□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 YIPF3-216ENST00000512713 306 ntTSL 28.61□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 38.27□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.42□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CABIN1-208ENST00000467937 593 ntTSL 317.93■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.113e-16■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-209ENST00000430407 1121 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-11■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-205ENST00000411533 1169 ntTSL 514□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-206ENST00000419074 997 ntTSL 513.17□□□□□ -0.32e-11■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RCC1-208ENST00000429051 538 ntTSL 310.88□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 RYK-201ENST00000460933 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 SPTA1-204ENST00000467387 465 ntTSL 57.17□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 314.41□□□□□ -0.18e-15■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 USP19-201ENST00000306026 1905 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 USP19-209ENST00000464931 616 ntTSL 316.01■□□□□ 0.155e-9■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 ATP13A1-213ENST00000497156 715 ntTSL 216.42■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.762e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-208ENST00000518656 1059 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-209ENST00000518913 2663 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-211ENST00000520970 4333 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-212ENST00000520982 3244 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 BMP1-210ENST00000520626 3925 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 42.5
EFTUD2Q15029 ESRRA-204ENST00000467987 610 ntTSL 325.48■■□□□ 1.676e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 TOLLIP-209ENST00000528719 669 ntTSL 423.35■■□□□ 1.336e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.986e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.746e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 TLE3-219ENST00000559826 354 ntTSL 214.96□□□□□ -0.016e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 TLE3-207ENST00000557815 7809 ntTSL 212.88□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 SLC2A4RG-204ENST00000482718 541 ntTSL 224.94■■□□□ 1.582e-36■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RBM8A-202ENST00000484825 542 ntTSL 511.58□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RBM8A-203ENST00000498663 764 ntTSL 211.04□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 SSH3-210ENST00000532881 2587 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.27□□□□□ -1.898e-11■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 IMP4-215ENST00000477375 564 ntTSL 216.78■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 217.18■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-201ENST00000336942 601 ntTSL 56.04□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-209ENST00000480115 394 ntTSL 54.86□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-211ENST00000546593 244 ntTSL 54.46□□□□□ -1.76e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-208ENST00000452157 5240 ntTSL 1 (best)3.78□□□□□ -1.86e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-210ENST00000497185 108 ntTSL 53.29□□□□□ -1.886e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.96e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.046e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.066e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 MIER3-206ENST00000440000 219 ntTSL 52.09□□□□□ -2.076e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 RNF213-205ENST00000558116 3768 ntTSL 28.88□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 STX5-207ENST00000491231 1719 ntTSL 521.68■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 42.4
EFTUD2Q15029 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 42.4
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1802.3 ms