Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCLAFQ15004 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCLAFQ15004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms