Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLCA4Q14CN2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLCA4Q14CN2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms