Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD9Q14511 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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