Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM39Q14498 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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