Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSHL1Q14406 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSHL1Q14406 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms