Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP1A4Q13733 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP1A4Q13733 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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