Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAMK2BQ13554 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAMK2BQ13554 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms