Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF5Q13243 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRSF5Q13243 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF5Q13243 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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