Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRN3Q13033 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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