Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK3Q13003 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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