Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIAQ12857 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms