Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 ERG3YLR056W 1098 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SKI2YLR398C 3864 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 MNS1YJR131W 1650 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP35YDR172W 2058 nt5.94□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RAP1YNL216W 2484 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RAD3YER171W 2337 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 PDR18YNR070W 4002 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 PPM1YDR435C 987 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 VOA1YGR106C 798 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RPL8AYHL033C 771 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RSM25YIL093C 795 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RPE1YJL121C 717 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 LSO1YJR005C-A 282 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 GAT2YMR136W 1683 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 MEF1YLR069C 2286 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 PTK2YJR059W 2457 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 ASF2YDL197C 1578 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 STB5YHR178W 2232 nt5.93□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 ECM3YOR092W 1842 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SWC4YGR002C 1431 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 CDC4YFL009W 2340 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 MED1YPR070W 1701 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 ATP5YDR298C 639 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 NBL1YHR199C-A 222 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 REE1YJL217W 597 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 RPN6YDL097C 1305 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 TUB3YML124C 1338 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 VPS33YLR396C 2076 nt5.92□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 ASN1YPR145W 1719 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 PEP7YDR323C 1548 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YJR015WYJR015W 1533 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 MPH2YDL247W 1830 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YNR063WYNR063W 1824 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 DDC1YPL194W 1839 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 BSC2YDR275W 708 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SDH7YDR511W 402 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SPG1YGR236C 288 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 TRM112YNR046W 408 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 UBC11YOR339C 471 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YPR098CYPR098C 486 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 GCR2YNL199C 1605 nt5.91□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 DIT2YDR402C 1470 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 OCT1YKL134C 2319 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 APE3YBR286W 1614 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YDL012CYDL012C 324 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YDR431WYDR431W 312 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 TDH3YGR192C 999 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 VMA10YHR039C-A 345 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YKR041WYKR041W 753 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 TAF14YPL129W 735 nt5.9□□□□□ -1.46
BUD20Q08004 YDR109CYDR109C 2148 nt5.9□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 RIO1YOR119C 1455 nt5.9□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 TOG1YER184C 2385 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 FUS1YCL027W 1539 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YDL094CYDL094C 510 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 MRPL38YKL170W 417 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YLL044WYLL044W 447 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 CDC42YLR229C 576 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 ATP14YLR295C 375 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 NOP15YNL110C 663 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 MRPS5YBR251W 924 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 ZUO1YGR285C 1302 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 CYC8YBR112C 2901 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 NGL3YML118W 1518 nt5.89□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 HRD1YOL013C 1656 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 SIT4YDL047W 936 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YGL072CYGL072C 360 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 RGI2YIL057C 495 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YJR012CYJR012C 624 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YLR269CYLR269C 351 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 TIM18YOR297C 579 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 FRM2YCL026C-A 582 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YJR003CYJR003C 1560 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 NDD1YOR372C 1665 nt5.88□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 RPS24BYIL069C 408 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 SHE2YKL130C 741 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 FCF2YLR051C 654 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 RPP0YLR340W 939 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 SUE1YPR151C 621 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 NDT80YHR124W 1884 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 NTH1YDR001C 2256 nt5.87□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 MUB1YMR100W 1863 nt5.86□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 YPS7YDR349C 1791 nt5.86□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 RRP45YDR280W 918 nt5.86□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 MPC3YGR243W 441 nt5.86□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 PAI3YMR174C 207 nt5.86□□□□□ -1.47
BUD20Q08004 FSH3YOR280C 801 nt5.86□□□□□ -1.47
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