Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK18Q07002 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK18Q07002 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms