Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms