Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms