Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms