Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID5AQ03989 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms