Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLOD1Q02809 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLOD1Q02809 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms