Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSG4Q00888 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG4Q00888 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG4Q00888 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSG4Q00888 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSG4Q00888 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms