Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC5Q00444 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms