Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX1P83916 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBX1P83916 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX1P83916 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX1P83916 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX1P83916 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms