Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ROMO1P60602 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms