Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2BFSP57053 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms