Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CTBP2P56545 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTBP2P56545 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms