Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L1P55209 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAP1L1P55209 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NAP1L1P55209 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms