Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGGT1BP53609 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PGGT1BP53609 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGGT1BP53609 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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