Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBP50607 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBP50607 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBP50607 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBP50607 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBP50607 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBP50607 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBP50607 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBP50607 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBP50607 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBP50607 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBP50607 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms