Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATMP50440 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATMP50440 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATMP50440 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATMP50440 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATMP50440 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATMP50440 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATMP50440 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATMP50440 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATMP50440 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATMP50440 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATMP50440 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GATMP50440 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms