Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AMTP48728 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AMTP48728 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AMTP48728 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AMTP48728 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMTP48728 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMTP48728 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AMTP48728 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AMTP48728 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms