Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA2P47869 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms